摘要：谷瘟病是谷子上毀滅性病害之一,為了探討不同地區谷瘟病菌群體的遺傳多樣性,對我國11個省(自治區) 171株谷瘟病菌的無毒基因AVR1-CO39進行擴增測序,并利用ClustalX2.0和DnaSP5.0軟件對測序結果進行分析。結果表明,171株谷瘟病菌單孢菌株AVR1-CO39的CDS編碼區共有40個多態性位點,依據序列之間的核苷酸差異劃分為37個單倍型,H1型為絕對優勢單倍型。我國11個省份谷瘟病菌群體的AVR1-CO39具有較高的遺傳多態性,由于存在較為頻繁的基因交流,種群之間沒有明顯的遺傳分化。種群內部的遺傳分化是谷瘟病菌遺傳分化的主要方式,錯配分布檢測結果顯示進化過程中可能出現群體擴張,并且谷瘟病菌的聚類與地理來源沒有顯著的關系。研究結果表明,谷瘟病菌無毒基因AVR1-CO39具有較高的變異性,以H1為核心單倍型在不斷地變異衍生出新的等位基因類型,并且這種變異衍生趨勢并不受地理隔離的影響。研究結果可為谷子抗病品種選育,揭示谷瘟病菌無毒基因與谷子抗病基因之間的互作機制提供理論支持。