瞬時受體電位M8型離子通道選擇性濾器的三維結構計算建模
作者：徐麗臻; 楊帆 浙江大學醫學院生物物理系; 浙江杭州310058
摘要：目的:構建瞬時受體電位M8型(TRPM8)離子通道選擇性濾器結構域的三維結構模型。方法:在Rosetta計算結構生物學工具包中,使用基于運動回路閉合算法的從頭計算,對TRPM8離子通道選擇性濾器結構域進行多輪計算建模。結果:經過9輪計算得到了能量最低且結構收斂的TRPM8通道選擇性濾器結構域的三維結構模型,發現D918位點的側鏈并不指向離子流過的孔區中心,而Q914、D920和T923位點的側鏈指向孔區中心;糖基化位點N934位于孔區外側,其側鏈指向胞外水環境。結論:構建了TRPM8通道選擇性濾器結構域的三維結構模型,為理解該通道的離子選擇性及相關機制提供了較為可靠的結構信息。
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