靶向果蠅Kr-h1基因的mi RNA預測及其生物信息學分析
作者：董文韜; 楊卓妮娜; 何倩毓; 劉勝軍 黑龍江八一農(nóng)墾大學動物科技學院; 黑龍江大慶163319
摘要：目的預測靶向果蠅Kr-h1(Krǜppel homolog1)基因的miRNA,并對其生物學功能及相關生物信息學進行分析,為進一步研究miRNA通過調(diào)控Kr-h1的表達而參與保幼激素(juvenile hormone,JH)對果蠅變態(tài)發(fā)育的調(diào)控奠定基礎。方法通過microT-CDS、Targetscan和miRanda在線預測網(wǎng)站,對靶向Kr-h1基因的miRNA進行預測,對預測得到的多個miRNA按靶向結合可能性的大小進行匯總,3個網(wǎng)站均能預測到的miRNA為交集miRNA,對交集miRNA的靶基因及Kr-h1基因進行生物信息學功能分析。結果 microT-CDS、Targetscan和miRanda分別預測到30、7和11個靶向Kr-h1的miRNA,其中交集miRNA有4個,為miR-8、miR-277、miR-927和miR-964。功能分析發(fā)現(xiàn),交集miRNA的靶基因主要參與細胞過程、生物過程和代謝過程,Kr-h1基因主要與昆蟲生長發(fā)育及生殖相關。結論潛在靶向Kr-h1的miRNA涉及多個生物學過程,與昆蟲的生長發(fā)育密切相關。
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中國生物制品學雜志
中國生物制品學雜志， 月刊，本刊重視學術導向，堅持科學性、學術性、先進性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：疫苗研究、基礎研究、治療制劑、診斷制劑、技術方法、綜述、專題報道等。于1988年經(jīng)新聞總署批準的正規(guī)刊物。
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