O157:H7型大腸埃希菌CRISPR結構及耐藥基因和毒力基因分布分析
作者：王鵬飛; 王穎芳; 段廣才; 郗園林; 徐亞珂; 陳帥印; 詹煜慧 河南科技大學醫院; 河南洛陽471023; 河南科技大學醫學院公共衛生教研室; 鄭州大學公共衛生學院流行病學教研室; 河南科技大學醫學院
摘要：目的了解O157:H7型大腸埃希菌中成簇的規律間隔短回文重復序列(Clustered Regularly Interspaced ShortPalindromic Repeats,CRISPR)結構特征以及耐藥基因和毒力基因分布情況。 方法利用多序列比對、BLAST、RNA二級結構預測等多種生物信息學方法對20株O157:H7型大腸埃希菌的全基因組序列進行分析。 結果從GenBank數據庫獲得2000-2014年20株O157:H7型大腸埃希菌全基因組序列,所有基因組中共存在3個CRISPR位點且每個CRISPR位點的基因序列具有高度一致性(均超過99.7%);CRISPR2被一段序列分隔為CRISPR2a和CRISPR2b;CRISPR1中存在3個不同的間隔序列,CRISPR2也有3個不同的間隔序列,CRISPR3有1個間隔序列;CRISPR1和CRISPR3的重復序列均可形成莖環結構,CRISPR2和CRISPR1的重復序列具有較高的一致性。共檢測7個耐藥基因,所有菌株ampc均陽性,4株菌株tetB和sul1陽性,其它4個基因均未檢出;共檢測6個毒力基因,有10株細菌stx1陽性,其他5個毒力基因20株細菌均陽性。 結論CRISPR在O157:H7型大腸埃希菌中廣泛分布且結構穩定,毒力基因分布廣,耐藥性問題不可忽視。
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中國病原生物學雜志
中國病原生物學雜志， 月刊，本刊重視學術導向，堅持科學性、學術性、先進性、創新性，刊載內容涉及的欄目：論著、調查研究、綜述等。于1988年經新聞總署批準的正規刊物。
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