摘要:利用生物信息學(xué)分析、預(yù)測(cè)葡萄Trihelix轉(zhuǎn)錄因子家族基因的特性與功能,為葡萄抗逆基因的挖掘和利用提供理論依據(jù)。以‘紅地球’葡萄(Vitis vinifera)試管苗為試驗(yàn)材料,對(duì)葡萄Trihelix轉(zhuǎn)錄因子家族進(jìn)行理化性質(zhì)、染色體定位、二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、亞細(xì)胞定位、基因結(jié)構(gòu)分析、motif以及基因芯片表達(dá)分析,并利用qRT-PCR技術(shù)分析該家族基因在400 mmol·L^-1 NaCl、100 mmol·L^-1 ABA和10%PEG逆境下的表達(dá)情況。結(jié)果表明,該轉(zhuǎn)錄因子家族在葡萄基因組中總共有27個(gè)成員,分布于11條染色體上,其中有10個(gè)成員集中分布在第14號(hào)和17號(hào)染色體上;氨基酸殘基為175~880個(gè),大多數(shù)具有疏水性。亞細(xì)胞定位分析表明,該基因家族主要存在于細(xì)胞核中。結(jié)構(gòu)域分析顯示,同一亞家族蛋白保守域結(jié)構(gòu)高度相似。基因芯片表達(dá)結(jié)果顯示,非生物脅迫下,葉片中VvTrihelix6在PEG處理24 h后與對(duì)照相比呈顯著上調(diào)趨勢(shì),當(dāng)用NaCl處理4h和24h后,與葉片對(duì)照相比有下調(diào)表達(dá)趨勢(shì);用ABA處理果實(shí)3d后,該基因在果實(shí)中呈下調(diào)表達(dá),處理10d后變化不明顯。葉片中VvTrihelix19轉(zhuǎn)錄因子經(jīng)PEG、NaCl和冷脅迫處理24 h后明顯下調(diào);果實(shí)用ABA處理3 d和10 d后均有明顯下調(diào)趨勢(shì)。qRT-PCR分析表明該轉(zhuǎn)錄因子家族所有基因?qū)δ婢趁{迫具有響應(yīng)作用,但是,不同成員在不同逆境脅迫下的響應(yīng)程度存在一定的差異。轉(zhuǎn)錄因子VvTrihelix6在400 mmol·L^-1 NaCl和100 mmol·L^-1 ABA處理下表達(dá)量極顯著高于對(duì)照,分別是對(duì)照的15倍和8倍;VvTrihelix19只在10%PEG脅迫處理后呈顯著上調(diào)表達(dá)。
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