基因表達數據批次效應去除方法的研究進展
作者：李颯; 趙毅強 中國農業大學農業生物技術國家重點實驗室; 北京100193
摘要：在組學和大數據時代,整合分析材料相同但時間、平臺、方法、技術和實驗室等不同批次的表達數據集將成為常態。但是,不同批次數據集由于非生物因素影響會產生批次效應,這種批次效應可能會對試驗結果產生嚴重影響,甚至導致錯誤結論。本文介紹了幾種去除基因表達數據批次效應的方法,包括ComBat方法、替代變量分析法、距離加權判別法和基于比值的方法等。通過前人研究和實例分析表明,ComBat方法是最好的去除基因表達譜數據集批次效應的方法。這些結果將為多批次表達數據集的整合分析提供參考依據。
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南京農業大學學報雜志
南京農業大學學報雜志， 雙月刊，本刊重視學術導向，堅持科學性、學術性、先進性、創新性，刊載內容涉及的欄目：動物科學、植物科學、生物與環境、食品與工程、植物科學、綜述、生物與環境、食品與工程、綜述等。于1956年經新聞總署批準的正規刊物。
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