摘要:自噬是細(xì)胞重要的代謝途徑,ATG8在自噬體形成過(guò)程中起著重要的作用。對(duì)ATG8蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析研究十分必要。本研究以NCBI中人ATG8同源蛋白序列數(shù)據(jù)為研究材料,分析其與10種模式生物間基因拷貝數(shù)、氨基酸序列、蛋白質(zhì)保守位點(diǎn)相關(guān)性。結(jié)果表明,人6種ATG8同源蛋白分別定位于5條染色體上,均有泛素樣GABARAP結(jié)構(gòu)域。并且,所有模式生物的ATG8同源蛋白中N-端氨基酸序列保守性強(qiáng)于C-端序列。本研究構(gòu)建的ATG8同源蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)顯示,人的ATG8同源蛋白與脊椎動(dòng)物(斑馬魚(yú),爪蟾,小鼠,大鼠,牛)的ATG8蛋白親緣關(guān)系更近,人的GABARAPs與酵母的ATG8蛋白與的親緣關(guān)系較近。本研究為研究細(xì)胞自噬過(guò)程及機(jī)制提供了豐富的生物進(jìn)化和生物信息數(shù)據(jù)支持。
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基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)雜志, 月刊,本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向,堅(jiān)持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進(jìn)性、創(chuàng)新性,刊載內(nèi)容涉及的欄目:綜述與專論、研究論文、研究報(bào)告、實(shí)驗(yàn)技術(shù)。等。于1982年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。