花生PDAT基因家族的全基因組生物信息學分析
作者：田海瑩; 單雷; 李新國; 郭峰; 張智猛; 孟靜靜; 萬書波; 彭振英 山東省農業(yè)科學院生物技術研究中心/山東省作物遺傳改良與生態(tài)生理重點實驗室; 山東濟南250100; 山東省花生研究所; 山東青島266100; 山東省農業(yè)科學院; 山東濟南250100
摘要：磷脂二酰甘油酰基轉移酶（phospholipids:diacylglycerol acyltransferase，PDAT）催化磷脂和二酰甘油反應，生成溶血磷脂和三酰甘油，是植物三酰甘油合成的關鍵酶之一。為了在全基因組水平上探究花生PDAT（AhPDAT）基因家族的特征，通過生物信息學方法，結合花生基因組和轉錄組數(shù)據(jù)對AhPDAT家族成員從系統(tǒng)進化、基因結構、表達模式以及可變剪接等方面進行系統(tǒng)分析。結果顯示，AhPDAT家族包含17個成員，不均勻分布于9條染色體上。系統(tǒng)進化分析發(fā)現(xiàn)，AhPDATs與大豆、苜蓿以及菜豆聚在一起，親緣關系較近。基因結構分析顯示，AhPDATs基因具有2~8個外顯子，可編碼88~742個氨基酸。表達模式分析發(fā)現(xiàn)，AhPDATs家族成員組織表達多樣化，這種表達模式的差異表明它們功能分工的不同。同時，該家族基因還存在豐富的可變剪接類型。這些結果為今后進一步開展AhPDATs基因家族的功能研究提供參考，同時也為花生品質育種奠定了一定的理論基礎。
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花生學報雜志
花生學報雜志， 季刊，本刊重視學術導向，堅持科學性、學術性、先進性、創(chuàng)新性，刊載內容涉及的欄目：栽培生理、土壤肥料、花生遺傳育種、栽培生理、植物保護、貯藏加工、分析測試、產業(yè)化等。于1972年經(jīng)新聞總署批準的正規(guī)刊物。
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